Workbench 3.0 (1992, mit A1200/A4000) brachte AGA-Unterstuetzung, Datatypes-System (einheitliche Dateiformat-Erkennung), verbesserte Intuition, neue Gadgets, PCMCIA-Support (A600/A1200). Workbench 3.1 (1994) war die letzte offizielle Commodore-Version und die am laengsten genutzte Amiga-OS-Version ueberhaupt. Sie bildet bis heute die Basis fuer Classic-Amiga-Setups. OS 3.1 setzte den Standard fuer Amiga-Kompatibilitaet.